研究员 博士生导师
生命科学联合中心研究员
北京大学博雅青年学者
个人简介
早年广泛开展基于化学的交叉学科研究，求学期间的研究领域涵盖了天然产物合成，高分子力化学，荧光与非线性光学探针，生物偶联化学和活细胞成像方法等方向。2018年在北大建立实验室后，专注开发基于小分子，高分子和生物大分子的成像探针和标记技术。科研理念致力于从分子视角，融汇有机合成，光谱学和化学生物学等领域的先进技术，推动生物成像探针领域的发展，为生物物理，细胞生物学，生理学和代谢等领域的研究提供得心应手的新工具。此外也积极探索分子工程与药物研发交叉领域的新方向。
目前在Science，Nature等杂志发表论文20余篇，申请专利3项。主持国家自然科学基金面上项目，北京市科委生命科学前沿创新培育项目等。与北京大学，清华大学，西湖大学等多个课题组，以及Boehringer Ingelheim等企业建立了广泛的合作研究。
所授课程
本科生：
《化学基础（整合科学）》（必修课，4学分）
研究生：
《化学生物技术与成像前沿进展》（通选课，3学分）
《成像探针研究进展》（通选课，3学分）
教育背景
2004-2008 清华大学 理学学士
2009-2014 哥伦比亚大学 博士 导师：Profs. Virginia W. Cornish & Wei Min
工作简历
2008.7-2009.8 北京大学研究助理
2015.3-2015.12 美国Columbia University博士后
2016.1 –2018.3 美国Stanford University博士后
2018.6-现在 北京大学未来技术学院，生命科学联合中心研究员
承担项目
n 国家自然科学基金面上项目
n 北京市科委生命科学前沿创新培育项目
代表性论文
Zhe Yang, Yu Zhang, Yuxin Fang, Yuan Zhang, Jiasheng Du, Xiaowen Shen, Kecheng Zhang, Peng Zou* & Zhixing Chen*. Spatial barcoding reveals reaction radii and contact-dependent mechanism of proximity labeling. Nature Chemical Biology 2025, online
Dilizhatai Saimi, Luc Reymond, Tursunjan Aziz, Xuan Shen, Ziying Luo, Shuaibo Pi, Yitong Liu, Song Fu, Shuangjin Ding, Anming Meng, Liangyi Chen, Hui Jiang & Zhixing Chen*. Imaging mitochondrial membrane potential via concentration-dependent fluorescence lifetime changes. Nature Communications 2025, 16, 11088
Jing Ling#, Yuan Zhang#*, Yongzhen Hei#, Julian Kompa, Chen Yang, Bo Wang, Junwei Zhang, Jiasheng Du, Tatjana Rudi, Kecheng Zhang, Jingfu Sun, Wenjuan Wang, Sebastian Fabritz, Yulong Li, Wulan Deng, Peng Zou, Chunlai Chen*, Zhixing Chen*. Thioether editing generally increases thephotostability of rhodamine dyes on self-labeling tags, PNAS 2025, 122, e2426354122
Jing Ling#, Yitong Liu#, Alexandre Dumoulin#, Danli Sheng, Yunzhe Fu, Shuzhang Liu, Ling Ding, Lulu Huang, Peng Xi, Hongyun Tang, Esther T. Stoeckli, and Zhixing Chen; A gentle palette of plasma membrane dyes. PNAS 2025, 122, e2504879122
Junwei Zhang, Kecheng Zhang, Kui Wang, Bo Wang, Siyan Zhu, Hongping Qian, Yumiao Ma, Mengling Zhang, Tianyan Liu, Peng Chen, Yuan Shen, Yunzhe Fu, Shilin Fang, Xinxin Zhang, Peng Zou, Wulan Deng, Yu Mu, Zhixing Chen*. A Palette of Bridged Bicycle-Strengthened Fluorophores. Nature Methods 2025, 22，1276
Liu, T.#; Kompa, J.#; Ling, J.#; Lardon, N.; Zhang, Y.; Chen, J.; Reymond, L.; Chen, P.; Tran, M.; Yang, Z.; Zhang, H.; Liu, Y.; Pitsch, S.; Zou, P.; Wang, L.; Johnsson, K.; Chen, Z.* Gentle rhodamines for live-cell fluorescence microscopy. ACS Central Science 2024, 10, 1933-44.
Chen, J.; Stephan, T.; Gaedke, F.; Liu, T.; Li, Y. Schauss, A.; Chen, P.; Wulff, V.; Jakobs, S.; Jüngst, C.*; Chen, Z.* An aldehyde-crosslinking mitochondrial probe for STED imaging in fixed cells. PNAS 2024, 121, e2317703121.
Liu, S.#; Ling, J.#; et al.; Zou, P.*; Chen, Z.* Orange/far-red hybrid voltage indicators with reduced phototoxicity enable reliable long-term imaging in neurons and cardiomyocytes. PNAS 2023, 120, e2306950120.
Liu, T.#; Stephan, T.#; Chen, P.; Keller-Findeisen, J.; Chen, J.; Riedel, D.; Yang, Z.; Jakobs, S.; Chen, Z.* Multi-color live-cell STED nanoscopy of mitochondria with a gentle inner membrane stain. PNAS 2022, 119, e2215799119 [Cover]
Mo, J.#; Chen, J.#; Shi, Y.; Sun, J.; Wu, Y.; Liu, T.; Zhang, J.; Zheng, Y.; Li, Y.; Chen, Z.* Third-Generation Covalent TMP-Tag for Fast Labeling and Multiplexed Imaging of Cellular Proteins. Angew. Chem. Int. Ed. 2022, 61, e202207905
Zhang, J.#; Peng, X.#; Wu, Y.#; Ren, H.#; Sun, J.; Tong, S.; Liu, T.; Zhao, Y.; Wang, S.; Tang, C.; Chen, L.; Chen, Z.* Red- and Far-Red-Emitting Zinc Probes with Minimal Phototoxicity for Multiplexed Recording of Orchestrated Insulin Secretion. Angew. Chem. Int. Ed. 2021, 60, 25846-55. [Inside Cover]
Yang, Z.#; Li, L.#; Ling, J.; Liu, T.; Huang, X.; Ying, Y.; Zhao, Y.; Zhao, Y.; Lei, K.*; Chen, L.*; Chen, Z.* Cyclooctatetraene-conjugated cyanine mitochondrial probes minimize phototoxicity in fluorescence and nanoscopic imaging. Chemical Science 2020, 11, 8506-8516.